O Windows Malicious Software Removal Tool andou atrazado em relação a outros Anti-Vírus do mercado, por alguma razão não incorporou detecção de MalWare mutantes e demorou a detectar programas nocivos como o PoisionIvy, o Posion é um backdoor que depois de instalador no computador, permite que ele seja administrado a distância sem que seu dono saiba e pode ter sido utilizado para capturar dados da RSA Security no inicio do ano.
A pouco tempo o MSRT começou a detectar e remover o Poision Ivy (depois de muita demora), mas ainda esta pecando em não ter rotinas inteligentes para detectar versões mutantes de um MalWare como o SpyEye, o MSRT somente detecta assinatura de versões conhecidas, mas quando uma mutação do SpyEye ocorre, o MSRT não reconhece como Malicioso.